D4-poly-LCA Paris descartes

Enseignement de Lecture critique d’article
Faculté de médecine Paris Descartes
1
Enseignement de
Lecture critique d’article (UE 16)
Polycopié de cours
2016/2017
Auteurs : Dr Agnès Dechartres, Dr Antoine Rachas, Dr Alexandra Rouquette, Dr Sophie
Grabar, Dr Isabelle Colombet, Dr Pierre Durieux
Enseignants : Pr Gilles Chatellier, Pr Joël Coste, Dr Isabelle Colombet, Dr Agnès
Dechartres, Dr Pierre Durieux, Dr Sophie Grabar, Dr Jean-Philippe Jais, Dr Anne-Sophie
Jannot, Dr Sandrine Katsahian, Dr Jean-Baptiste Escudié, Dr Vincent Looten, Dr Amélie
Yavchitz, Dr Moussa Laanani
Responsables : Dr Agnès Dechartres, Dr Pierre Durieux

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Table des matières
1
ère
partie ................................................................................................................... 9
1.1 Structure d’un article ................................................................................................10
1.1.1 Article, rapport d’étude et protocole .................................................................10
1.1.2 Format d’un article .............................................................................................10
1.1.3 Transparence (reporting) ...................................................................................15
1.2 Formulation de l’objectif et choix du type d’étude .................................................16
1.2.1 Formulation de l’objectif ....................................................................................16
1.2.2 Mots-clés correspondant au type d’étude ........................................................17
1.2.3 Adéquation entre le type d’étude et la question posée ...................................18
1.3 Constitution d’un échantillon dans lequel l’étude sera réalisée ............................19
1.3.1 Echantillon, population source et population cible .........................................19
1.3.2 Notion de fluctuations d’échantillonnage .........................................................21
1.3.3 Constitution de l’échantillon ..............................................................................21
1.4 Rappels de biostatistiques .......................................................................................22
1.4.1 Les différents types de variable ........................................................................23
1.4.2 Les différentes étapes de l’analyse statistique ................................................25
1.4.2.1. Analyse descriptive .......................................................................................25
1.4.2.2 Etude de l’association entre 2 variables (analyse univariée) ..........................34
1.4.2.3 Analyse multivariée ........................................................................................45
1.5 Biais et validité interne .............................................................................................54
1.5.1 Notion de biais ....................................................................................................54
1.5.2 Les principaux biais ...........................................................................................55
1.5.2.1 Biais de sélection ...........................................................................................55
1.5.2.2 Biais de classement .......................................................................................57
1.5.2.3 Biais de confusion ..........................................................................................59
1.5.3 Quels sont les réflexes à avoir ? .......................................................................60
1.5.4 Définition de la validité interne ..........................................................................61
1.6 Validité externe ........................................................................................................61
1.7 Niveau de preuve d’une étude .................................................................................62

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2
ème
partie : Spécificités des différents types d’articles...................................... 64
2.1 Evaluation d’un test diagnostique ...........................................................................65
2.1.1 Formulation de l’objectif ....................................................................................66
2.1.2 Type d’étude .......................................................................................................66
2.1.3 Population d’étude .............................................................................................66
2.1.4 Choix du test de référence .................................................................................66
2.1.5 Réalisation des tests (test à évaluer et test de référence) ...............................67
2.1.6 Evaluation de la performance diagnostique d’un test .....................................67
2.1.6.1 Mesure de la validité d’un test diagnostique ...................................................67
2.1.6.2 Mesure de la fiabilité d’un test diagnostique ...................................................74
2.1.7 Rappels des différents biais pouvant affecter une étude d’évaluation
diagnostique ................................................................................................................77
2.1.8 Recommandations pour rapporter un article diagnostique ............................77
2.2 Evaluation étiologique ..............................................................................................80
2.2.1 Formulation de l’objectif ....................................................................................81
2.2.2 Type d’étude .......................................................................................................81
2.2.2.1 Choix entre étude cas-témoin et étude de cohorte ........................................81
2.2.2.2 Principe des études de cohorte et cas-témoin ................................................82
2.2.3 Particularités des études de cohorte ................................................................84
2.2.3.1 Choix de la population ....................................................................................84
2.2.3.2 Recueil des facteurs de risque .......................................................................84
2.2.3.3 Recueil de la maladie (critère de jugement) ...................................................85
2.2.3.4 Suivi et problème des données manquantes dans les études de cohorte
prospective ................................................................................................................85
2.2.4 Particularités des études cas-témoin ................................................................86
2.2.4.1 Population d’étude .........................................................................................86
2.2.4.2 Recueil des facteurs de risque .......................................................................87
2.2.5 Prise en compte des facteurs de confusion potentiels ...................................88
2.2.6 Interprétation des résultats ...............................................................................89
2.2.7 Causalité .............................................................................................................90

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2.2.8 Rappels des biais dans les études étiologiques ..............................................91
2.2.9 Recommandations pour rapporter une étude étiologique...............................93
2.3 Evaluation de facteurs pronostiques ......................................................................96
2.3.1 Formulation de l’objectif ....................................................................................97
2.3.2 Distinction facteur de risque/ facteur pronostique ..........................................97
2.3.3 Type d’étude utilisé ............................................................................................98
2.3.4 Les biais dans les études pronostiques ...........................................................99
2.4 Evaluation d’une intervention thérapeutique ........................................................ 100
2.4.1 Formulation de l’objectif .................................................................................. 101
2.4.2 Type d’étude ..................................................................................................... 101
2.4.3 Choix du comparateur ...................................................................................... 102
2.4.4 Randomisation.................................................................................................. 103
2.4.4.1 Génération de la séquence de randomisation .............................................. 104
2.4.4.2 Clause d’ignorance ...................................................................................... 106
2.4.4.3 Vérification de la comparabilité initiale des groupes ..................................... 108
2.4.5 Le maintien de la comparabilité des groupes pendant l’essai ...................... 110
2.4.5.1 Le double aveugle ........................................................................................ 110
2.4.5.2 L’analyse en intention de traiter ................................................................... 112
2.4.6 Les critères de jugement ................................................................................. 117
2.4.6.1 Définition d’un critère de jugement principal ................................................. 117
2.4.6.2 Pertinence clinique du critère de jugement ................................................... 1 1 7
2.4.6.3 Notion de subjectivité/objectivité .................................................................. 119
2.4.6.4 Disponibilité chez tous les patients (faisabilité du recueil du critère de
jugement) ................................................................................................................. 120
2.4.6.5 Critères composites ..................................................................................... 121
2.4.7 Calcul d’effectif ................................................................................................. 122
2.4.8 Respect des règles éthiques et enregistrement des essais .......................... 123
2.4.8.1 Règles éthiques ........................................................................................... 123
2.4.8.2 Enregistrement des essais ........................................................................... 123
2.4.9 Interprétation des résultats d’un essai ........................................................... 125

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2.4.9.1 Interprétation des résultats pour le critère de jugement principal .................. 125
2.4.9.2 Interprétation des résultats pour les critères secondaires ............................. 126
2.4.9.3 Interprétation d’une analyse intermédiaire .................................................... 127
2.4.9.4 Interprétation des analyses en sous-groupe ................................................. 128
2.4.9.5 Interprétation des résultats de tolérance ...................................................... 130
2.4.10 Plans expérimentaux particuliers .................................................................. 130
2.4.10.1 Les essais en cross-over............................................................................ 130
2.4.10.2 Les essais d’équivalence ou de non-infériorité ........................................... 132
2.4.11 Rappel des biais dans un essai contrôlé randomisé ................................... 134
2.4.12 Recommandations de reporting pour les essais contrôlés randomisés .... 135
2.5 Evaluation d’une intervention de prévention ou de dépistage ............................ 139
2.5.1 Prévention ......................................................................................................... 139
2.5.2 Dépistage .......................................................................................................... 140
2.5.2.1 Définitions .................................................................................................... 140
2.5.2.2 Avantages et inconvénients d’une procédure de dépistage .......................... 141
2.5.2.3 Maladies candidates au dépistage ............................................................... 141
2.5.2.4 Test disponible pour le dépistage ................................................................. 142
2.5.3 Formulation de l’objectif .................................................................................. 143
2.5.4 Type d’étude ..................................................................................................... 143
2.5.5 Points à évaluer ................................................................................................ 144
2.5.6 Biais spécifiques aux études d’évaluation d’une procédure de dépistage .. 145
2.5.7 Critères justifiant la mise en place d’un dépistage organisé ........................ 146
Glossaire ............................................................................................................... 148